Für das <ref xmlns="http://www.tei-c.org/ns/1.0" target="https://edition-humboldt.de/register/pflanzen/index.xql?l=de">Pflanzenregister</ref> werden keine eigenen Einträge in TEI-XML-Registerdateien angelegt (wie bei den anderen Registern). Stattdessen werden die wissenschaftlichen Pflanzennamen in den edierten Texten mit Hilfe der entsprechenden TEI-Kodierung annotiert, ggf. normalisiert und dann automatisch ausgelesen. Das Pflanzenregister wird somit komplett dynamisch erstellt. Zu jedem distinkten Pflanzennamen werden die Belegstellen in den Texten gelistet und automatisiert mit verschiedenen taxonomischen Datenbanken verlinkt (siehe unten, Abschnitt <ref xmlns="http://www.tei-c.org/ns/1.0" target="https://edition-humboldt.de/H0016212/globalnames">Globale Indizes für wissenschaftliche Namen</ref>).