Allerdings ist das Kuba-Manuskript in seiner Form nicht typisch für die Tagebücher Humboldts. Es ist von 1 bis 38 durchnummeriert, wobei diese lineare Systematik offenbar Humboldt nicht ausreichte, so dass er sich des Hilfsmittels vieler Querverweise bediente. So betreffen die Nummern 2, 6, 10, 13, 15b, 25, 28, 31, 34 und 35 das Thema Sklaverei, und in manchen dieser Nummern wird aufeinander verwiesen (z. B. in Nr. 34 auf 28 und umgekehrt), wodurch sich aus der linearen Struktur eine gewisse Relationalität entwickelt: typisch für Humboldts Versuche, konventionelle Darstellungsformen auszuweiten.