Verließ die Expedition die Fernstraßen für Exkursionen, griff Humboldt auch auf andere Transportmittel zurück. Für kurze Ausflüge in schwer zugängliche Gegenden boten sich dabei Pferde an. Auf längeren Exkursionen nutzten die Forscher auch Kibitkas und gebirgstaugliche sibirische Wagen. Für Reiseabschnitte außerhalb des Postnetzes schickte man gelegentlich Pferde zum Wechseln voraus. Je nach Möglich- oder Notwendigkeit fuhr man auch mit kleinen Booten oder, solange hinreichend Brennholz verfügbar war, mit Dampfschiffen.