Der Wissensgraph, der durch EncycNet entstehen soll, fasst das Wissen von 6 allgemeinen Enzyklopädien zusammen. Alle diese Enzyklopädien unterscheiden sich hinsichtlich der Auswahl und Organisation der Konzepte, der inneren Struktur der Einträge, Umfang und Auslegung der Definitionen und dem Stil. Jede dieser Eigenheiten müssen für die Informationsextraktion berücksichtigt werden, was bedeutet, dass die Relationen für alle Enzyklopädien neu beurteilt werden müssen. Pragmatisch betrachtet heißt dies auch, dass die Informationsdichte im resultierenden Graph abnimmt, da weniger Relationen in Betracht genommen werden können. Insbesondere auf mögliche Inferenzbildungen durch den Graph wirkt sich das negativ aus.