Sofern jedoch die Formate nicht äquivalent sind, wovon im Allgemeinen ausgegangen werden muss, kann die Konvertierung mit Informationsverlust verbunden sein, vor allem dann, wenn die betreffenden Informationen im Zielformat der Konvertierung grundsätzlich nicht repräsentierbar sind. So kann die Erstellung eines Datenobjektes durch Konvertierung lediglich der Startpunkt sein, an welchem die dem Ausgangs- und Zielformat gemeinsamen Inhalte übernommen werden und von wo aus die formatspezifischen Inhalte dann vom Nutzer einzupflegen sind. Sollten für das Zielformat relevante Daten im Ausgangsformat fehlen, so sind auch diese vom Nutzer zu ergänzen. Die gleiche Art von Informationsverlust ist auch bei der Rückkonvertierung zu bedenken. Für den Anwender steigt also der Pflegeaufwand für die in mehreren Formaten vorgehaltenen Daten in dem Maße, in dem konvertierungsbedingter Informationsverlust und -ergänzung manuell ausgeglichen werden müssen. Die Konvertierung automatisiert lediglich die Pflege der redundanten Inhalte, d. h., die Schnittmenge der Datensammlung in den verschiedenen Formaten. Denkbar ist es in einigen Fällen, die nicht in der Schnittmenge enthaltenen Informationen separat zu den Datenformaten zu speichern, um sie bei der Rückkonvertierung wieder einzupflegen. Eine weitere Voraussetzung für eine (zumindest in weiten Teilen) automatisierte Rückkonvertierung stellt das Wissen über die Transformationshistorie dar.