Im Forschungskontext werden solche Notebooks daher verwendet, um auf einer (Web-)Seite Datensätze einzulesen, zu analysieren, visualisieren und die verwendete Methodik zu erläutern, ohne dies auf verschiedene Orte oder Zugänge verteilen zu müssen. In der (Nach-)Nutzung können z. B. Parameter in der Analyse oder Visualisierung direkt im Browser verändert werden und eine Anpassung ohne Programmierkenntnisse oder -erfahrung ermöglichen. Die Notebook-Dateien können wiederum über entsprechende Softwareentwicklungs-Repositorien zur Verfügung gestellt werden, was Anpassungen für weitere Datensätze oder Forschungsfragen erlaubt. Jupyter-Notebooks sind dabei als JSON-Dokumente strukturiert verarbeitbar.