Die Datenakquisition im WissKI-System erfolgt primär über karteikartenähnliche Formulare oder Freitextfelder, beides tradierte Formen der Datenerfassung in den vorliegenden Anwendungsbereichen. Die Daten werden vom System im Hintergrund jedoch durch das CIDOC-CRM semantisch erschlossen, d. h. neben den Daten wird auch ihre ontologiebezogene Bedeutung für Mensch und Maschine lesbar gespeichert. Hierzu bedient sich WissKI konsequent der Techniken des Semantic Web wie RDF und OWL-DL und zielt auf Veröffentlichung der Daten als Linked Open Data. Die eingegebenen Daten bilden einen Wissensgraphen, der auf einfache Weise weltweit und (potentiell) transdisziplinär vernetzt werden kann. Die formale Ontologie, die über eine hierarchische Struktur von Konzepten und Eigenschaften und einer standardisierten logischen Sprache ein System von Fachbegriffen bildet, dient der Erfassung und semantischen Erschließung der Daten. Je nach Fachgebiet und Sammlungsschwerpunkt kann das CIDOC-CRM als grundlegende Ontologie um fachspezifische Begriffe mit Anwendungsontologien erweitert werden. Diese flexible Art der Wissensspeicherung lässt schnell und unproblematisch Änderungen des Datenmodells am laufenden System zu. Durch die Einbindung einer standardisierten logischen Sprache und die Nutzung von Open-Source-Software ermöglicht WissKI eine hohe Anschlussfähigkeit, leichte Zugänglichkeit und Langzeit-Interpretierbarkeit der Daten.