Die Kategorie <hi xmlns="http://www.tei-c.org/ns/1.0" rend="italic">Tertiärdokument</hi> wurde in ModiKo geprägt, um einen dritten Typ von Dokumenten terminologisch fassen zu können – die Mehrebenen-Annotation von Sekundärdokumenten (Reimer et al. 2015). Tertiärdokumente geben dem Forscher die Möglichkeit, Sekundärdokumente durch die Notation verschiedener Phänomene wie sprachbegleitende Gesten (z. B. <hi xmlns="http://www.tei-c.org/ns/1.0" rend="italic">auf etw. zeigen</hi>), (materielle) Objekte (z. B. Klemmbrett, Kugelschreiber) sowie kontextuelle und verbale Informationen zu ergänzen. Das für MID-bezogene Phänomene zu entwickelnde Annotationssystem orientiert sich an dem in Trevisan (2014) entwickelten Mehrebenen-Annotationsansatz und adaptiert ihn gegenstandsspezifisch.