Neben der Unterstützung der vielfältigen Analysemethoden ist eine weitere Herausforderung für die Analysewerkzeuge, dass historische Korpora je nach Forschungskontext und -frage unterschiedlich erstellt und aufbereitet werden (Lüdeling 2011). Dies zeigt sich unter anderen in den vielfältigen Transkriptions- und Normalisierungsverfahren (vgl. z.B. Odebrecht et al. 2016; Krasselt et al. 2015; Archer et al. 2015; Bollmann et al. 2012; Jurish 2010) und Annotationsguidelines (für z.B. Annotation von Wortarten für historisches Deutsch Coniglio et al. 2016; Dipper et al. 2013) sowie verschiedenen Formaten (z.B. Romary et al. 2015; Schmidt und Wörner 2009; Burnard und Baumann 2008; Wittenburg et al. 2006; Dipper 2005), die allein für die Erstellung von historischen Korpora eingesetzt werden.